More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1609 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  100 
 
 		 419 aa  843    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  59.81 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  59.35 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  59.11 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.58 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  56.44 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  56.78 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.34 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  56.31 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  56.54 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  56.54 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  56.31 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  56.88 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  56.88 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  57.01 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  56.64 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  56.31 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  51.41 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.65 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  56.84 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  60.23 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  53.72 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  53.72 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.23 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  53.1 
 
 		 437 aa  401  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  53.95 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.07 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  59 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  50.71 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  50.7 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  50.34 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.92 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.67 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  60.25 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.22 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.27 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.22 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 435 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.41 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.9 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.56 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  56.7 
 
 		 338 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  47.7 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  57.01 
 
 		 338 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  56.25 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.18 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.3 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  55.14 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.58 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  50.12 
 
 		 439 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.39 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.77 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  54.83 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.74 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.26 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  45.96 
 
 		 457 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 354 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.09 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  44.93 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 327 aa  319  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.69 
 
 		 326 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.18 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.78 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  44.37 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  53.78 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  53.78 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  52.98 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 337 aa  308  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.03 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  52.97 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.31 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.99 
 
 		 491 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  50.84 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  45.73 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  45.75 
 
 		 541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  46.56 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  52.68 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  49.44 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  45.92 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.43 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 356 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>