More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3350 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  786    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  58.41 
 
 		 338 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.46 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  54.57 
 
 		 391 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  58.95 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  58.51 
 
 		 349 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  57.19 
 
 		 338 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  55.19 
 
 		 332 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  56.88 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  54.01 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.36 
 
 		 347 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.44 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  55.26 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  56.27 
 
 		 353 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  56.27 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 353 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  55.59 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.47 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.73 
 
 		 344 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.35 
 
 		 344 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.35 
 
 		 344 aa  329  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 365 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  54.33 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.4 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  55.76 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  54.9 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  54.33 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  55.76 
 
 		 370 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  51.41 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.44 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.15 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.15 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  53.87 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  54.09 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.95 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  53.87 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  53.87 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.52 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  54.24 
 
 		 353 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.76 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.73 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.03 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.56 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  55.16 
 
 		 346 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 349 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  55.15 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  54.77 
 
 		 327 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 370 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 338 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.69 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  53.37 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  54.43 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  53.96 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 435 aa  318  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  54.43 
 
 		 338 aa  318  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.77 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  55.35 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  53.35 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  52.94 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 407 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.61 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.06 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.82 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 348 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.95 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 408 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  56.83 
 
 		 343 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.28 
 
 		 427 aa  315  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.98 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  56.67 
 
 		 350 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.45 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  52.85 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.86 
 
 		 348 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.71 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.6 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>