More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4180 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  100 
 
 
354 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  99.44 
 
 
354 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  99.15 
 
 
354 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  84.09 
 
 
353 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  55.03 
 
 
338 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  58.21 
 
 
338 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  58.64 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  55.49 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.28 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  56.68 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.19 
 
 
426 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  55.96 
 
 
346 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  53.89 
 
 
338 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  53.67 
 
 
370 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  57.4 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  57.1 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  55.02 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  55.59 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  55.59 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.44 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  56.19 
 
 
428 aa  318  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.35 
 
 
434 aa  318  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.18 
 
 
417 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  54.94 
 
 
419 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  53.75 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  51.85 
 
 
423 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  53.75 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  54.68 
 
 
365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.01 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  52.79 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.19 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  54.41 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.69 
 
 
387 aa  312  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  54.1 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.47 
 
 
425 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.98 
 
 
428 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.98 
 
 
428 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  53.94 
 
 
450 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.51 
 
 
347 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  55.12 
 
 
422 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  54.98 
 
 
427 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  53.51 
 
 
435 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  53.8 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  55.29 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  52.37 
 
 
358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  54.68 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.68 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.74 
 
 
464 aa  309  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  54.76 
 
 
353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  54.1 
 
 
357 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.34 
 
 
371 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  52.42 
 
 
435 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  52.69 
 
 
362 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  53.58 
 
 
370 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.24 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  54.6 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  54.41 
 
 
353 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  53.5 
 
 
373 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  53.58 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  53.71 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.42 
 
 
370 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.35 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  54.01 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  49.86 
 
 
500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.44 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  53.19 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  52.27 
 
 
430 aa  305  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  50.15 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  53.5 
 
 
353 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.92 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  53.64 
 
 
439 aa  305  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.95 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.95 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  50.15 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  52.89 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.64 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.95 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  50.15 
 
 
424 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  53.5 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.01 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  53.53 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  53.67 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  52.89 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.51 
 
 
458 aa  302  6.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  51.18 
 
 
354 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  53.37 
 
 
370 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  53.37 
 
 
370 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  53.05 
 
 
358 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>