More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1240 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  100 
 
 		 391 aa  788    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.95 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  61.85 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  61.52 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.28 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  64.95 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.83 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.86 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.35 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  60.34 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  60.69 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  62.02 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  63.22 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.39 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  60.23 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  62.43 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  63.14 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.39 
 
 		 344 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  64.85 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  63.24 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.77 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.77 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  63.92 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  63.24 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  65.26 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  63.28 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  63.03 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  64.74 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.04 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  60.78 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  61.06 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  63.75 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  65.26 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  60.5 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.04 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  60.91 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  59.7 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  59.39 
 
 		 342 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  59.39 
 
 		 342 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.57 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.95 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.62 
 
 		 370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.71 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 346 aa  298  7e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.45 
 
 		 350 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  48.74 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.46 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.9 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 326 aa  292  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  47.86 
 
 		 353 aa  292  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  46.53 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  50.59 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.39 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 329 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  47.45 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 329 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.06 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.81 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.84 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.9 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.34 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  46.9 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.65 
 
 		 371 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 352 aa  282  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  46.71 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.58 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  47.21 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.75 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.65 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.75 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>