More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0165 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  100 
 
 		 343 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  76.88 
 
 		 337 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  76.13 
 
 		 337 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  73.21 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  78.02 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  69.57 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  70.28 
 
 		 327 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.77 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  51.38 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  52.74 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.12 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.67 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 332 aa  309  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.02 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  51.55 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  51.56 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  52.16 
 
 		 435 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.31 
 
 		 426 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  56.84 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.57 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  54.19 
 
 		 353 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.15 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.08 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.73 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.84 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  50.15 
 
 		 351 aa  295  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  53.49 
 
 		 357 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.25 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  55.82 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.93 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  55.82 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  53.49 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 362 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.98 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.48 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.26 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.62 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  53.61 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.49 
 
 		 350 aa  288  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  52.43 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.77 
 
 		 348 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  46.96 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  54.45 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.96 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.16 
 
 		 396 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  54.79 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  46.87 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.76 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.65 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.91 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.17 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.91 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.5 
 
 		 463 aa  285  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.55 
 
 		 427 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.17 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.91 
 
 		 354 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  54.3 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.31 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.66 
 
 		 482 aa  284  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.9 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  54.2 
 
 		 406 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  51.14 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  54.3 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  54.11 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  54.2 
 
 		 406 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.74 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.78 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  46.76 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  53.2 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.52 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.78 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.35 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>