More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1871 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  100 
 
 		 338 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  80 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  73.21 
 
 		 343 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  73.52 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  77.43 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  70.5 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.06 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.16 
 
 		 340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  54.43 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  56.21 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  55.66 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  52.76 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.46 
 
 		 387 aa  325  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  52.6 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  54.57 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  54.27 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  56.17 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.89 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  54.38 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  54.91 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.78 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.52 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.79 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.98 
 
 		 354 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.98 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.69 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.68 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.98 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.66 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  51.19 
 
 		 395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  51.81 
 
 		 351 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 392 aa  301  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.54 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  51.81 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.88 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  52.27 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.55 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  51.07 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  51.22 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.71 
 
 		 358 aa  298  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.44 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 407 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.25 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.42 
 
 		 406 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.14 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.25 
 
 		 425 aa  295  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.15 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.63 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.58 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.43 
 
 		 405 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.12 
 
 		 458 aa  293  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  55.76 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  54.15 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.24 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 408 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.55 
 
 		 350 aa  292  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  50 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  50.14 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 408 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 408 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>