More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2078 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  100 
 
 		 327 aa  657    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  72.76 
 
 		 326 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  72.14 
 
 		 337 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  68.71 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  70.28 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  71.52 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  70.5 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.96 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.06 
 
 		 340 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  54.88 
 
 		 335 aa  328  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  51.07 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  53.82 
 
 		 346 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  56.1 
 
 		 435 aa  324  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.77 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  55.79 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  52.41 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  52 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 394 aa  317  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.53 
 
 		 353 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  53.75 
 
 		 427 aa  309  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  55.21 
 
 		 419 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  52 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.61 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.7 
 
 		 359 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.4 
 
 		 417 aa  302  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  55.86 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.85 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.43 
 
 		 434 aa  301  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  56.55 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  53.12 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  55.86 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  50 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  54.66 
 
 		 356 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 361 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50 
 
 		 379 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.78 
 
 		 405 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  48.65 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  56.79 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 430 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.95 
 
 		 463 aa  292  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 430 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.2 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  56.01 
 
 		 397 aa  291  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  51.78 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  50.34 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  53.63 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.98 
 
 		 464 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  49.54 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  53.45 
 
 		 370 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  51.1 
 
 		 430 aa  288  6e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.2 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>