More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2532 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  852    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.03 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  59.81 
 
 
419 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  58.55 
 
 
428 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.14 
 
 
426 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  55.4 
 
 
427 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.97 
 
 
428 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  57.14 
 
 
432 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  55.74 
 
 
428 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  55.27 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  55.5 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  60.33 
 
 
424 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.48 
 
 
417 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  55.04 
 
 
428 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  52.67 
 
 
430 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  52.67 
 
 
430 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.93 
 
 
425 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  55.3 
 
 
437 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  53.95 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  54.48 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  56.71 
 
 
423 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  53.69 
 
 
435 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  51.17 
 
 
423 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  59.44 
 
 
425 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  50.81 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.89 
 
 
438 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  50 
 
 
439 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.46 
 
 
435 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.23 
 
 
435 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.67 
 
 
463 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.68 
 
 
426 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  58.33 
 
 
346 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 
482 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.66 
 
 
437 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  52.91 
 
 
439 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.89 
 
 
464 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.33 
 
 
452 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.02 
 
 
439 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  51.15 
 
 
437 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.15 
 
 
454 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.88 
 
 
458 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.14 
 
 
429 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  48.71 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  48.71 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 
464 aa  359  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  48.39 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.76 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  47.2 
 
 
428 aa  355  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.13 
 
 
426 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  54.41 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  55.02 
 
 
338 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47.58 
 
 
434 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.33 
 
 
387 aa  342  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.68 
 
 
338 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.31 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  54.71 
 
 
338 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50 
 
 
370 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.66 
 
 
434 aa  332  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.9 
 
 
427 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  52.2 
 
 
353 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.19 
 
 
353 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  47.9 
 
 
457 aa  328  9e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  51.06 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.38 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  45.01 
 
 
424 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  55.29 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  53.54 
 
 
356 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  42.79 
 
 
500 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  44.78 
 
 
424 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.89 
 
 
372 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  51.69 
 
 
362 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.6 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  52.3 
 
 
364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  53.45 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  51.99 
 
 
361 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  53.73 
 
 
370 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  51.84 
 
 
355 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  44.55 
 
 
424 aa  319  5e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.57 
 
 
356 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.45 
 
 
345 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.29 
 
 
371 aa  318  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.12 
 
 
354 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.12 
 
 
354 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.12 
 
 
354 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.22 
 
 
428 aa  318  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  54.41 
 
 
357 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  54.05 
 
 
373 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.17 
 
 
369 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  54.08 
 
 
357 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>