More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2309 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  100 
 
 		 326 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  72.76 
 
 		 327 aa  464  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  72.22 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  71.47 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  69.57 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  70.19 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.29 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  54.6 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.15 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 394 aa  321  9.000000000000001e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.94 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  55.15 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  53.35 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 435 aa  316  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.05 
 
 		 353 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  51.55 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  51.38 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.72 
 
 		 463 aa  311  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  50 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.62 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.78 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.48 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.35 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.33 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.15 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 354 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  52.69 
 
 		 419 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 354 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  54.4 
 
 		 422 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.23 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.75 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.55 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  54.27 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.14 
 
 		 464 aa  296  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.7 
 
 		 358 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.2 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  51.85 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 406 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.17 
 
 		 427 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  50 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  50 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  50 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  52.47 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 406 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  51.71 
 
 		 349 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  52 
 
 		 458 aa  291  9e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 405 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.7 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  51.1 
 
 		 348 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.8 
 
 		 350 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  49.85 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.17 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.17 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  52.15 
 
 		 350 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  50 
 
 		 339 aa  285  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  47.92 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  53.15 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.34 
 
 		 425 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.66 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.88 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.17 
 
 		 407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  50 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  50.47 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  46.04 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.64 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.92 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.87 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.77 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 357 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>