More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0366 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  100 
 
 		 439 aa  880    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  58.77 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  55.66 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  55.43 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  48.05 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.33 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.39 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.58 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.96 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.35 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 346 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  45.31 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.08 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  54.49 
 
 		 338 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.01 
 
 		 463 aa  319  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  45.39 
 
 		 419 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.31 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 353 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.41 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 338 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.63 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.33 
 
 		 417 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.01 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.74 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  44.37 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.73 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.26 
 
 		 387 aa  305  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.2 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 354 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 354 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.97 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.42 
 
 		 428 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.92 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.55 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.55 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 370 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 428 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 428 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 428 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  43.78 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.93 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.44 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.69 
 
 		 365 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.79 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  42.09 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  43.45 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.93 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  51.53 
 
 		 346 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 372 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.29 
 
 		 356 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  47.74 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.82 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.95 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.73 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  51.38 
 
 		 358 aa  292  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  42.28 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.95 
 
 		 454 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  48.38 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.22 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  48.67 
 
 		 368 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 343 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 337 aa  289  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.72 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.95 
 
 		 370 aa  288  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 364 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 362 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 337 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>