More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0372 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  100 
 
 		 434 aa  866    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  62.07 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  62.07 
 
 		 435 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  58.77 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.77 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.07 
 
 		 426 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.33 
 
 		 423 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.47 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.01 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.26 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  47.21 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.74 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.5 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.58 
 
 		 422 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  45.71 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.83 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.52 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.09 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  45.58 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.6 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.65 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.46 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.05 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.65 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.92 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  43.85 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.03 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  44.8 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  44.8 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  42.56 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  44.39 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.33 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  45.14 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.37 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 365 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.16 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.68 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 338 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.72 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.38 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.33 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.08 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.01 
 
 		 353 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.09 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.25 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  43.91 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  47.83 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40 
 
 		 500 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.15 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  48.57 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  43.61 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.15 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.25 
 
 		 387 aa  292  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.63 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 372 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 373 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.84 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.84 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.53 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.99 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  42.69 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.78 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.31 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.77 
 
 		 336 aa  289  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 345 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  41.71 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 370 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  48.38 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 338 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>