More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0872 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  100 
 
 		 428 aa  855    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.54 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  57.11 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  56.88 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  57.64 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  56.98 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  57.18 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  54.86 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  53.61 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  52.33 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  53.95 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  52.33 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  52.33 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  53.7 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  53.7 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  53.26 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  53.94 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  53.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  52.71 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  50.92 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.1 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  50.7 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  46.51 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.77 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.25 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.2 
 
 		 422 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.17 
 
 		 425 aa  353  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.28 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  49.77 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.64 
 
 		 427 aa  345  7e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  50 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.99 
 
 		 482 aa  336  3.9999999999999995e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.24 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  44.87 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.58 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.54 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.52 
 
 		 437 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.71 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  48.71 
 
 		 425 aa  308  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.65 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.82 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.38 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.32 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 338 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.23 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.84 
 
 		 464 aa  298  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.77 
 
 		 336 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.19 
 
 		 491 aa  295  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  44.16 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.56 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 352 aa  293  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.33 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.2 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  47.16 
 
 		 338 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  46.24 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.11 
 
 		 353 aa  286  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  47.09 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  46.97 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  48.65 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.8 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  47.94 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.66 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0505  GTPase ObgE  40.65 
 
 		 435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.96 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  46.92 
 
 		 373 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  46.92 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  47.19 
 
 		 397 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.67 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  44.76 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 364 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  45.54 
 
 		 338 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  47.89 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>