More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05980 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.12 
 
 
463 aa  656    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
464 aa  937    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.84 
 
 
464 aa  666    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.62 
 
 
482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.11 
 
 
417 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.78 
 
 
419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.83 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.1 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.78 
 
 
425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.12 
 
 
422 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.78 
 
 
426 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  45.59 
 
 
500 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.25 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  47.33 
 
 
423 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  42.79 
 
 
427 aa  333  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.24 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  44.84 
 
 
427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  45.18 
 
 
428 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  44.96 
 
 
428 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  43.24 
 
 
430 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  43.24 
 
 
430 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.23 
 
 
426 aa  326  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.17 
 
 
424 aa  326  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  44.22 
 
 
428 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  45.18 
 
 
428 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  45.18 
 
 
428 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  55.19 
 
 
346 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  44.22 
 
 
428 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  44.96 
 
 
428 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  44.96 
 
 
428 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.78 
 
 
428 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  44.74 
 
 
428 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  44.47 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.04 
 
 
505 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  47.23 
 
 
424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.04 
 
 
437 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.73 
 
 
425 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.9 
 
 
491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.93 
 
 
427 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.98 
 
 
423 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  48.89 
 
 
425 aa  319  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.13 
 
 
434 aa  318  9e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.13 
 
 
430 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  45.93 
 
 
516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.29 
 
 
387 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  46.78 
 
 
541 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  46.15 
 
 
563 aa  312  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.32 
 
 
338 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  45.39 
 
 
509 aa  310  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  47.23 
 
 
529 aa  310  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.27 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  44.86 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  41.47 
 
 
439 aa  307  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.75 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.39 
 
 
438 aa  306  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.97 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  45.92 
 
 
519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  47.74 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.97 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  43.98 
 
 
493 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.06 
 
 
452 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.04 
 
 
454 aa  302  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  44.27 
 
 
439 aa  302  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  44.81 
 
 
513 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.9 
 
 
338 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.61 
 
 
454 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  40.84 
 
 
428 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.72 
 
 
439 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  46.17 
 
 
481 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.8 
 
 
450 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  44.74 
 
 
476 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.28 
 
 
354 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.44 
 
 
429 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  41.41 
 
 
437 aa  297  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.57 
 
 
353 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.28 
 
 
354 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.28 
 
 
354 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  42.08 
 
 
424 aa  296  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  41.23 
 
 
428 aa  295  8e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  41.23 
 
 
428 aa  295  8e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  42.16 
 
 
435 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.2 
 
 
503 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  42.31 
 
 
424 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.88 
 
 
480 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.03 
 
 
488 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  44.94 
 
 
560 aa  292  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.98 
 
 
415 aa  292  9e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  41.4 
 
 
424 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.68 
 
 
338 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.68 
 
 
338 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.84 
 
 
486 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.06 
 
 
356 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.69 
 
 
428 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  38.24 
 
 
440 aa  286  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  43.61 
 
 
509 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50.66 
 
 
326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  44.72 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.05 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>