More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1618 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  100 
 
 
563 aa  1129    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  79.82 
 
 
560 aa  791    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.34 
 
 
505 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.52 
 
 
503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.77 
 
 
517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  58.44 
 
 
509 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  57.84 
 
 
519 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  56.05 
 
 
500 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  54.25 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.3 
 
 
488 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  55.82 
 
 
493 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.49 
 
 
463 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  54.17 
 
 
509 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  56.3 
 
 
450 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  54.76 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.99 
 
 
486 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  54.73 
 
 
529 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  53.8 
 
 
529 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  54.79 
 
 
480 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.92 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  52.87 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  54.21 
 
 
482 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  54.09 
 
 
485 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  54.09 
 
 
485 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  54.09 
 
 
485 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  55.98 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.67 
 
 
454 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  54.27 
 
 
454 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.5 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  53.83 
 
 
479 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  54.76 
 
 
541 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  52.45 
 
 
504 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  56.91 
 
 
476 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  52.85 
 
 
481 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.97 
 
 
480 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  55.41 
 
 
529 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  52.34 
 
 
516 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  51.67 
 
 
481 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.15 
 
 
464 aa  357  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.94 
 
 
463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.61 
 
 
482 aa  331  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.95 
 
 
426 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.73 
 
 
464 aa  320  6e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  44.52 
 
 
428 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  44.08 
 
 
428 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.86 
 
 
428 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  43.42 
 
 
428 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  43.64 
 
 
428 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  43.64 
 
 
428 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  43.42 
 
 
428 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  43.64 
 
 
428 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  45.83 
 
 
428 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.86 
 
 
428 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  44.87 
 
 
432 aa  296  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.98 
 
 
428 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.98 
 
 
427 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.03 
 
 
425 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.19 
 
 
435 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  39.91 
 
 
427 aa  286  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.74 
 
 
437 aa  286  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  48.38 
 
 
338 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  42.27 
 
 
422 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.97 
 
 
353 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.23 
 
 
430 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.23 
 
 
430 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  41.19 
 
 
419 aa  276  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  44.66 
 
 
423 aa  276  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.54 
 
 
426 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  41.7 
 
 
428 aa  272  9e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.56 
 
 
338 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.75 
 
 
338 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  38.58 
 
 
434 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  40.57 
 
 
435 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  40.13 
 
 
430 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  40.57 
 
 
435 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.88 
 
 
425 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  41.19 
 
 
424 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.12 
 
 
423 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  46.31 
 
 
354 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.26 
 
 
458 aa  263  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  48.15 
 
 
348 aa  263  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  44.97 
 
 
338 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  46.31 
 
 
354 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  45.76 
 
 
364 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  46.31 
 
 
354 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  46.61 
 
 
338 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.17 
 
 
346 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  45.48 
 
 
364 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.89 
 
 
434 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  41.2 
 
 
437 aa  259  8e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  45.17 
 
 
353 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  46.02 
 
 
338 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.51 
 
 
429 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  44.51 
 
 
397 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  44.03 
 
 
366 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  39.91 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  39.91 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  44.41 
 
 
362 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  44.73 
 
 
425 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  45.35 
 
 
373 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>