More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0002 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  100 
 
 		 424 aa  858    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  92.22 
 
 		 424 aa  769    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  97.41 
 
 		 424 aa  808    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.78 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.07 
 
 		 423 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.02 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.43 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  44.32 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.39 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.26 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  42.46 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.33 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.99 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.65 
 
 		 353 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  46.17 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.22 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.54 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.23 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.22 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40.09 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.11 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.16 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  42.18 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.6 
 
 		 439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  44.63 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.31 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.51 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.96 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.62 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.09 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  41.49 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  41.47 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.36 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.53 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.28 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.28 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.72 
 
 		 505 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.16 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  41.8 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.53 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  46.83 
 
 		 338 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  47.13 
 
 		 366 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.13 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.15 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  43.74 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  43.74 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.12 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.25 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.01 
 
 		 428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  46.67 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  40.38 
 
 		 516 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  44.99 
 
 		 345 aa  269  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  41.57 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.22 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.72 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.53 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  41.34 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  42.42 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  46.31 
 
 		 343 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.37 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.94 
 
 		 350 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.26 
 
 		 344 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.26 
 
 		 344 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  45.51 
 
 		 353 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  40.98 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.04 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.55 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.18 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  41.1 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.04 
 
 		 338 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  45.3 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.2 
 
 		 342 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  44.14 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  38.85 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  46.36 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  44.48 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  44.73 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.11 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>