More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0959 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  100 
 
 		 343 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  70.33 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  71.04 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.15 
 
 		 350 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  71.04 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  74.03 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  70.62 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  65.89 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  66.98 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  61.47 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  61.77 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  63.72 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  59.38 
 
 		 327 aa  361  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  64.22 
 
 		 329 aa  355  5e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  59.69 
 
 		 327 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  59.38 
 
 		 327 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  65.14 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  62.33 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  53.56 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 432 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.43 
 
 		 426 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  54.93 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.75 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  53.41 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.61 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.01 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  52.55 
 
 		 406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.99 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  53.67 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.21 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  54.24 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.03 
 
 		 345 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  54.6 
 
 		 354 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  54.6 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.52 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  51.94 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  54.3 
 
 		 354 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.3 
 
 		 370 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  56.46 
 
 		 405 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  50.93 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  55.82 
 
 		 402 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  50.73 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.08 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  54.05 
 
 		 422 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 391 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 407 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.55 
 
 		 438 aa  298  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  50.45 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  52.02 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 		 343 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  51.4 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  51.71 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.52 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 408 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  51.09 
 
 		 353 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 327 aa  295  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 357 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  50.59 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  54.3 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  51.21 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  55.02 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  55.97 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.89 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.96 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.2 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 430 aa  292  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.82 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 430 aa  292  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>