More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0233 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  100 
 
 		 332 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  84.42 
 
 		 350 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  66.87 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  66.06 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.95 
 
 		 391 aa  417  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  66.87 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  66.87 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.16 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.65 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  65.35 
 
 		 349 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  65.05 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.36 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.36 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  64.05 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.11 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  64.63 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.33 
 
 		 344 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.93 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  61.77 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  60.42 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  65.11 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.65 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.12 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.12 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  61.59 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  62.65 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  62.95 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  61.03 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  64.17 
 
 		 342 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.24 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  64.17 
 
 		 342 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  61.47 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  60.73 
 
 		 341 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  63 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  62.31 
 
 		 344 aa  360  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  63.11 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  59.45 
 
 		 336 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  59.09 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  58.66 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  59.52 
 
 		 366 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.19 
 
 		 387 aa  338  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.51 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.94 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 407 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.94 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.85 
 
 		 407 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.06 
 
 		 350 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 347 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 379 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 406 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.11 
 
 		 371 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.22 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 406 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 338 aa  291  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  49.19 
 
 		 340 aa  291  8e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  48.18 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  49.26 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  46.77 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  53.15 
 
 		 363 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 329 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.06 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.06 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  51.37 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.55 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.93 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  51.08 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.34 
 
 		 390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>