More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4198 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  95.6 
 
 		 364 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  100 
 
 		 364 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  83.63 
 
 		 336 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  83.82 
 
 		 366 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  70.78 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  73.93 
 
 		 349 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  73.57 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  73.57 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  74.54 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  70.66 
 
 		 353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  70.96 
 
 		 353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  67.24 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  70.06 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  69.16 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.46 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.81 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.12 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  67.07 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  69 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.05 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.34 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.66 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.66 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.25 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.04 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.1 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  65.87 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.35 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  64.99 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  64.71 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  63.53 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  64.6 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  58.94 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  64.29 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  64.29 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.71 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  58.66 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  58.06 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  56.6 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.85 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 426 aa  309  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.45 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 340 aa  299  7e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.42 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  46.15 
 
 		 352 aa  289  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.26 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  47.45 
 
 		 340 aa  287  2.9999999999999996e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.22 
 
 		 370 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.86 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.71 
 
 		 369 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  46.04 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.2 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  46.48 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  46.48 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.25 
 
 		 419 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 361 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  46.61 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.39 
 
 		 425 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.24 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  46.94 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.29 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  43.4 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  48.29 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.72 
 
 		 350 aa  276  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.06 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.04 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.79 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.99 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.48 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.81 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.06 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 428 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.37 
 
 		 340 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 432 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.06 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>