More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3280 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 346 aa  693    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  79.19 
 
 		 348 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.14 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.41 
 
 		 342 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.7 
 
 		 344 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  72.83 
 
 		 349 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  73.43 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.76 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  73.71 
 
 		 353 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.76 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  72.57 
 
 		 353 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.99 
 
 		 342 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  71.92 
 
 		 356 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.23 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  72.54 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  72.67 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  72.19 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  72.04 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  72.19 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.55 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  71.52 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  71.12 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  67.92 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  69.18 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  69.25 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  63.22 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  64.13 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  67.18 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  71.04 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  63.58 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  65.05 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  65.05 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  66.16 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  65.44 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  61.34 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  59.71 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.1 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  63 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  57.23 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  58.72 
 
 		 348 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.7 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  60.84 
 
 		 387 aa  315  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  49.04 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49.36 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 338 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.17 
 
 		 326 aa  292  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  51.49 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.14 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.14 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.83 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.52 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.79 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  55.94 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  53.49 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.29 
 
 		 458 aa  284  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.22 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  54.55 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  53.82 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  50.77 
 
 		 422 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.72 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.48 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.72 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  57.69 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  54.9 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.91 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  54.2 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.02 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  53.63 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  47.52 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  52.43 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  53.42 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.89 
 
 		 408 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  53.2 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  53.2 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.89 
 
 		 408 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  53.2 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.89 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.49 
 
 		 350 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.44 
 
 		 390 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 390 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.23 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  45.1 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.31 
 
 		 338 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>