More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1986 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 340 aa  671    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  56.97 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.01 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.23 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  53.66 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  56 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  53.41 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  54.28 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 408 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  54.19 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  55.16 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.94 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 395 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  53.12 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  54.1 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.03 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.15 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.81 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  51.16 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.67 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.38 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  51.98 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  52.77 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  53.99 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.08 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  54.22 
 
 		 333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  51.63 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  54.73 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  54.44 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.94 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  52.27 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  54.49 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  54.44 
 
 		 354 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 357 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  51.01 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.73 
 
 		 426 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 354 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  51.62 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 370 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 357 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.05 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.47 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  51.63 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.08 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 379 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  52.78 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 397 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  50.88 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 353 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.33 
 
 		 397 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.17 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>