More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1054 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  100 
 
 
341 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  95.01 
 
 
341 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  95.01 
 
 
371 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  77.34 
 
 
339 aa  508  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  78.38 
 
 
336 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.27 
 
 
342 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.45 
 
 
342 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.39 
 
 
343 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  76.99 
 
 
349 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.85 
 
 
344 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.77 
 
 
344 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  74.17 
 
 
364 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.17 
 
 
344 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.17 
 
 
344 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  73.27 
 
 
364 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  74.7 
 
 
366 aa  447  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.39 
 
 
346 aa  448  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.29 
 
 
348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.6 
 
 
348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  67.05 
 
 
353 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  70.91 
 
 
343 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  66.47 
 
 
353 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  66.76 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  68.9 
 
 
356 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  66.28 
 
 
358 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  66.37 
 
 
349 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  67.54 
 
 
354 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  69.64 
 
 
345 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  66.67 
 
 
358 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.12 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  66.97 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  66.67 
 
 
359 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  66.97 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  66.97 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  65.96 
 
 
344 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  62.54 
 
 
351 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  63.06 
 
 
350 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  60.73 
 
 
332 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.18 
 
 
348 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  59.2 
 
 
345 aa  359  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  55.85 
 
 
352 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.87 
 
 
387 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50.3 
 
 
364 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.42 
 
 
347 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.59 
 
 
397 aa  298  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50 
 
 
364 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.42 
 
 
350 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.06 
 
 
338 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.6 
 
 
345 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.41 
 
 
366 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  48.84 
 
 
363 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  48.28 
 
 
361 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  52.28 
 
 
406 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  49.14 
 
 
357 aa  292  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.29 
 
 
458 aa  291  7e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  51.98 
 
 
406 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.86 
 
 
392 aa  291  8e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.04 
 
 
406 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.99 
 
 
364 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  48.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.16 
 
 
370 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.28 
 
 
407 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.55 
 
 
356 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.99 
 
 
407 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.18 
 
 
370 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.91 
 
 
357 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50 
 
 
397 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  51.03 
 
 
362 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.44 
 
 
357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  54.51 
 
 
402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  49.86 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.85 
 
 
371 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.4 
 
 
369 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.38 
 
 
365 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52 
 
 
365 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.57 
 
 
390 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  47.02 
 
 
340 aa  287  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.95 
 
 
407 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50.72 
 
 
356 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.84 
 
 
362 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  49.57 
 
 
390 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.54 
 
 
329 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.54 
 
 
329 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.13 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.13 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  50 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.43 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  49.71 
 
 
390 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  49.71 
 
 
390 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.13 
 
 
354 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  49.71 
 
 
390 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  47.16 
 
 
357 aa  285  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  55.18 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  55.18 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  55.18 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>