More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4213 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 343 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  91.84 
 
 		 342 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  81.63 
 
 		 342 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  82.27 
 
 		 344 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  81.69 
 
 		 344 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  81.69 
 
 		 344 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  77.03 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.85 
 
 		 348 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  73.94 
 
 		 341 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  73.65 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  73.65 
 
 		 371 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.15 
 
 		 346 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  68.29 
 
 		 353 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  69.71 
 
 		 353 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  72.34 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  74.22 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.81 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  68.79 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  69.12 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  71.12 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  74.3 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  68.37 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  68.8 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  70.41 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  68.93 
 
 		 364 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  71.3 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  65.8 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.65 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  63.59 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.36 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  65.31 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  71.43 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  66.46 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  64.72 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  64.72 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  61.63 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.06 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.46 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  57.56 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  58.05 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.83 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.91 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.16 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 345 aa  301  9e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  54.49 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.15 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.85 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.94 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  45.56 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  51.98 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.76 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  49.18 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.31 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.16 
 
 		 426 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.26 
 
 		 350 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  44.61 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.51 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.3 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.62 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.48 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.12 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.43 
 
 		 406 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.45 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.11 
 
 		 408 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>