More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3874 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  96.84 
 
 		 364 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  100 
 
 		 364 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  84.52 
 
 		 336 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  84.44 
 
 		 366 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  74.23 
 
 		 349 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  75.15 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  74.47 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  74.47 
 
 		 371 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  72.09 
 
 		 339 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  70.82 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  70.06 
 
 		 353 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  70.36 
 
 		 353 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.67 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  69.46 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.19 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  69.76 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.05 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.82 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.64 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.9 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  67.37 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  69.51 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.9 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.19 
 
 		 346 aa  428  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.35 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.28 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  68.11 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  65.59 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  66.15 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  64.05 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  63.53 
 
 		 351 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  62.57 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  62.57 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  59.24 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  62.57 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  65.33 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  59.09 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  59.51 
 
 		 345 aa  361  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  59.02 
 
 		 348 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.07 
 
 		 387 aa  309  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.56 
 
 		 426 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 340 aa  305  9.000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.71 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  49.25 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  48.7 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.59 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.54 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 353 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 397 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.58 
 
 		 417 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.49 
 
 		 434 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  46.85 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.71 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.37 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 427 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.54 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.97 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  46.92 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.81 
 
 		 364 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 338 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.18 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 435 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.97 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.29 
 
 		 350 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.74 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.86 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  48.86 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.11 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.69 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  49.22 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>