More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1705 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  100 
 
 		 348 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  72.99 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  70.82 
 
 		 352 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  64.63 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  63.86 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.42 
 
 		 350 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  63.75 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  59.09 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  60.79 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.37 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  57.64 
 
 		 349 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  60.79 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.39 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.5 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  58.09 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.25 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  57.39 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  60.52 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.9 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.59 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  59.94 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  59.27 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.31 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.31 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.19 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  58.1 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  58.5 
 
 		 345 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  60.18 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  60.55 
 
 		 341 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  60.55 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  57.75 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  58.74 
 
 		 348 aa  350  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.2 
 
 		 346 aa  349  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  56.77 
 
 		 342 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  56.77 
 
 		 342 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  58.06 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  58.51 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  59.02 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  55.62 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  58.41 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.35 
 
 		 387 aa  318  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.67 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  51.89 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.56 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.43 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.15 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  46.36 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  46.5 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.39 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  44.9 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.49 
 
 		 350 aa  272  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.11 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.29 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.13 
 
 		 374 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.29 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.13 
 
 		 374 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 407 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 407 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  49.41 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.98 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  48.13 
 
 		 345 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.6 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  53.95 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  53.61 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  53.42 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  47.89 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  50.28 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.17 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.38 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.05 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.38 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 390 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.22 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  53.1 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  46 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.41 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.55 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>