More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0157 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  100 
 
 
353 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  94.33 
 
 
353 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  94.89 
 
 
353 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  86.53 
 
 
356 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  86.93 
 
 
349 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  85.2 
 
 
358 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  83.52 
 
 
358 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.71 
 
 
344 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.39 
 
 
342 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.46 
 
 
344 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.46 
 
 
344 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.57 
 
 
344 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.43 
 
 
342 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.76 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.17 
 
 
343 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.23 
 
 
346 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.31 
 
 
348 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  70.06 
 
 
364 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  65.06 
 
 
343 aa  427  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  70.55 
 
 
349 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  69.46 
 
 
364 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  69.33 
 
 
371 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  69.33 
 
 
341 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.69 
 
 
350 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  68.39 
 
 
341 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.87 
 
 
332 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  65.34 
 
 
339 aa  421  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  61.52 
 
 
391 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  66.46 
 
 
351 aa  411  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  61.9 
 
 
354 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.57 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  64 
 
 
359 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  62.29 
 
 
345 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  60.57 
 
 
345 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  68.39 
 
 
336 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  63.71 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  70.12 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  63.71 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  59.09 
 
 
348 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.11 
 
 
344 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  57.83 
 
 
352 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.21 
 
 
387 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  54.97 
 
 
340 aa  315  5e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.49 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  50.3 
 
 
340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.71 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.98 
 
 
392 aa  308  9e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.4 
 
 
338 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.75 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  52.8 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.48 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.77 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.25 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.03 
 
 
407 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.5 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.19 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.5 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.48 
 
 
402 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.04 
 
 
408 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.49 
 
 
407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  47.77 
 
 
408 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  47.77 
 
 
408 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.58 
 
 
366 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.78 
 
 
434 aa  301  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.92 
 
 
338 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.49 
 
 
408 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.24 
 
 
338 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.42 
 
 
365 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.49 
 
 
364 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.89 
 
 
365 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  52.73 
 
 
357 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.67 
 
 
370 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 
426 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.49 
 
 
364 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50.6 
 
 
353 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  48.46 
 
 
406 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.66 
 
 
338 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  51.4 
 
 
343 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.59 
 
 
392 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.15 
 
 
345 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.43 
 
 
350 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.6 
 
 
369 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.79 
 
 
372 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.01 
 
 
379 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  51.52 
 
 
362 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  51.79 
 
 
370 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.04 
 
 
390 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.42 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.04 
 
 
390 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  48.89 
 
 
405 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  51.2 
 
 
419 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.3 
 
 
346 aa  292  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.39 
 
 
345 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.59 
 
 
390 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>