More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1480 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 348 aa  698    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.69 
 
 		 344 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.97 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.81 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.39 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.1 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.81 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.81 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  68.97 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  70.93 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  66.09 
 
 		 349 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  72.81 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  70.93 
 
 		 371 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  65.71 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  66.29 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  65.43 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.31 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.55 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  71.52 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  66.57 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  66.09 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  67.8 
 
 		 354 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  67.98 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  68.4 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  67.24 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  65.8 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  66.77 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  63.58 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  68.26 
 
 		 364 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  70.31 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  67.07 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.36 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  69.07 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  62.93 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  61.78 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  62.07 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  62.07 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.94 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  58.91 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  57.83 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  55.84 
 
 		 352 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.44 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  54.98 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 338 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  57.53 
 
 		 402 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  52.27 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.45 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.23 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.84 
 
 		 406 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.56 
 
 		 390 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  52.56 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.99 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  49.08 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.42 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.11 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.43 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 345 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  50.31 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.42 
 
 		 422 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 352 aa  295  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 350 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  54.52 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  54.01 
 
 		 392 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.22 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  53.69 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.63 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  55.52 
 
 		 364 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53 
 
 		 340 aa  291  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  55.52 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  53.58 
 
 		 391 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  54.07 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  54.07 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  51.86 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  54.07 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  51.05 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>