More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2445 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  100 
 
 		 337 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  77.51 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  76.13 
 
 		 343 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  76.35 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  72.22 
 
 		 326 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  72.14 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  73.52 
 
 		 338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  55.69 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.74 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  54.97 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 335 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.5 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  50.76 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.94 
 
 		 426 aa  318  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.01 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.27 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.54 
 
 		 434 aa  309  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  51.83 
 
 		 435 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  53.96 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  53.21 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.69 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.07 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.12 
 
 		 425 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.85 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.4 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.92 
 
 		 350 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.14 
 
 		 356 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 423 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.4 
 
 		 417 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.12 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.8 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.54 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.82 
 
 		 482 aa  293  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  47.94 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  52.82 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  55.94 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.56 
 
 		 395 aa  292  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  55.59 
 
 		 406 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  53.23 
 
 		 372 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.59 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.62 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.11 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.08 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  54.79 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  54.79 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.18 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.26 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.89 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.94 
 
 		 348 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 366 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.96 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 440 aa  288  8e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.23 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  55.14 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  46.79 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.94 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.09 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.21 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.23 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  52.68 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  55.25 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  46.94 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>