More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3009 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  100 
 
 		 336 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  84.52 
 
 		 364 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  83.63 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  89.57 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  77.18 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  78.48 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  77.18 
 
 		 371 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  70.09 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  75.46 
 
 		 349 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.47 
 
 		 342 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.56 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.76 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.37 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.15 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.72 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.72 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.43 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.86 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  70.36 
 
 		 345 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.31 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  67.96 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  67.37 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  67.66 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  67.96 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  69.02 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  68.06 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  66.97 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  65.26 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  65.87 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  65.45 
 
 		 342 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  65.76 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  60.53 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  65.45 
 
 		 342 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  65.77 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.24 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  59.45 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  58.51 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  57.45 
 
 		 345 aa  351  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.89 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.86 
 
 		 387 aa  316  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.4 
 
 		 350 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 340 aa  296  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.16 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.33 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.33 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  47.62 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  49.04 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.09 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.16 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.26 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 379 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.88 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.25 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  47.88 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 343 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 354 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.97 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 406 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.09 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 406 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.43 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  45.67 
 
 		 343 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.77 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.67 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.37 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.33 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.05 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  44.64 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 365 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  48.04 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.56 
 
 		 407 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.75 
 
 		 402 aa  278  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 407 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.49 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  44.01 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 405 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  45.51 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.09 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  46.78 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>