More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2789 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  100 
 
 
351 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  65.92 
 
 
354 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.29 
 
 
344 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.77 
 
 
348 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  61.65 
 
 
353 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  63.22 
 
 
350 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  64.16 
 
 
332 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  61.65 
 
 
353 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  65.14 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  61.19 
 
 
353 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  61.19 
 
 
349 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.15 
 
 
342 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  60.86 
 
 
356 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  65.44 
 
 
349 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  61.71 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  59.33 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.46 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  63.92 
 
 
391 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  64.87 
 
 
358 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.54 
 
 
342 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.03 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.46 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.14 
 
 
344 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.35 
 
 
344 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.35 
 
 
344 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  63.89 
 
 
359 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  61.7 
 
 
341 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  59.71 
 
 
345 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  62.54 
 
 
341 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  61.7 
 
 
371 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.68 
 
 
348 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  60.42 
 
 
339 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  62.91 
 
 
364 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  62.91 
 
 
364 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  63.58 
 
 
342 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  63.58 
 
 
342 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.41 
 
 
346 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  60.69 
 
 
336 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  61.14 
 
 
344 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  61.33 
 
 
366 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  58.81 
 
 
352 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.74 
 
 
387 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.56 
 
 
356 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.46 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50.77 
 
 
402 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.88 
 
 
426 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.93 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.14 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.42 
 
 
350 aa  301  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.76 
 
 
329 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.76 
 
 
329 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  50 
 
 
343 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.86 
 
 
390 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  49.86 
 
 
390 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50 
 
 
346 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.58 
 
 
395 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.61 
 
 
338 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  47.02 
 
 
336 aa  296  3e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50 
 
 
405 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  48.13 
 
 
392 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.38 
 
 
347 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.29 
 
 
372 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.71 
 
 
361 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  50.64 
 
 
340 aa  296  5e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.44 
 
 
370 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.81 
 
 
370 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  48.99 
 
 
345 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.15 
 
 
406 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  50.3 
 
 
389 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  50.89 
 
 
342 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  52.16 
 
 
405 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.63 
 
 
352 aa  292  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.14 
 
 
434 aa  292  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  50.14 
 
 
390 aa  292  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.66 
 
 
369 aa  292  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.38 
 
 
440 aa  292  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.81 
 
 
338 aa  292  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.99 
 
 
357 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  51.59 
 
 
370 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  51.85 
 
 
405 aa  291  9e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.1 
 
 
337 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  45.83 
 
 
355 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>