More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3802 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  100 
 
 		 359 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  97.37 
 
 		 342 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  97.37 
 
 		 342 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  75.8 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  75 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  74.2 
 
 		 345 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  75.36 
 
 		 344 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.2 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  64.29 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  64.57 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.24 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  64 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  63.79 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.62 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.67 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.64 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.37 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  65.96 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  65.96 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  62.01 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  66.26 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  63.89 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  61.3 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.34 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.04 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  60.24 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  65.11 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.5 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.5 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  62.57 
 
 		 364 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.29 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  64.6 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  65.56 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  64.6 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  59.52 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  64.91 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 348 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  56.81 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.17 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.43 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  54.1 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  52.74 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.29 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  53.04 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  53.51 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.93 
 
 		 364 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.93 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  52.76 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  55.09 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.55 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  52.45 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  52.79 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.57 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  54.05 
 
 		 386 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.93 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.83 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  57.09 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  51.67 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  51.17 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  53.75 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  53.17 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  50.65 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  53.45 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  54.65 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.55 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  51.2 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  49.68 
 
 		 340 aa  296  5e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  53.12 
 
 		 408 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  53.12 
 
 		 408 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.13 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  53.12 
 
 		 408 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  52.35 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>