More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0423 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  100 
 
 		 356 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  89.11 
 
 		 353 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  86.53 
 
 		 353 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  87.68 
 
 		 353 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  86.25 
 
 		 349 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  81.41 
 
 		 358 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  86.14 
 
 		 358 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.31 
 
 		 344 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.13 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.85 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.47 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.47 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.09 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.22 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.6 
 
 		 342 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.22 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  70.82 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  70.73 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.02 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  68.9 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  69.33 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  63.98 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  69.33 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  69.72 
 
 		 349 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 332 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  65.64 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  60.69 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  63.4 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.93 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  68.3 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  66.97 
 
 		 343 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  69.02 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  62.73 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  58.45 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  66.15 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  66.15 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.79 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.6 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.29 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.87 
 
 		 387 aa  325  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.35 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  51.33 
 
 		 407 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.03 
 
 		 407 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.04 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  56.51 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.81 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.56 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  48.29 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.57 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 406 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  53.35 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.65 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  48.9 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 		 350 aa  299  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.03 
 
 		 356 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  49.44 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.99 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.68 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  51.05 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  50.56 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.22 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>