More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4115 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  100 
 
 		 352 aa  700    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.53 
 
 		 350 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  72.42 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  73.03 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  73.03 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  67.65 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  65.89 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  66.11 
 
 		 359 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  62.88 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  62.01 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  62.27 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  60.73 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  58.59 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  61.96 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  56.13 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  58.59 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  61.09 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  62.94 
 
 		 327 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.25 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 440 aa  312  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 395 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  52.03 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.33 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  53.39 
 
 		 397 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.03 
 
 		 346 aa  308  6.999999999999999e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.72 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  53.87 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  53.87 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 408 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  49.44 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 408 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.56 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  49.72 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 427 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  51.02 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.96 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.37 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.59 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.87 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  51.94 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  52.97 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 405 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.79 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 402 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.46 
 
 		 373 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  53.31 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.86 
 
 		 369 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.86 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  51.46 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  52.74 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.94 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.87 
 
 		 379 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 336 aa  295  8e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  49.29 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  53.09 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.16 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  49.17 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  54.05 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.61 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  50.89 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.86 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.63 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>