More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02481 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  100 
 
 
327 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  88.07 
 
 
327 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  88.38 
 
 
327 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  88.38 
 
 
327 aa  517  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  67.28 
 
 
329 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  67.59 
 
 
329 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  63.27 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  65.44 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  64.53 
 
 
329 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  63.91 
 
 
329 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  60.24 
 
 
338 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  59.38 
 
 
343 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  61.35 
 
 
342 aa  359  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  58.46 
 
 
329 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  58.46 
 
 
329 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.75 
 
 
350 aa  352  7e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  58.41 
 
 
359 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  56.13 
 
 
352 aa  339  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  46.79 
 
 
337 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.05 
 
 
356 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.54 
 
 
427 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  55.12 
 
 
346 aa  286  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.63 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  46.04 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.94 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  48.63 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  46.65 
 
 
327 aa  281  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  47.71 
 
 
343 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  51.2 
 
 
397 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.85 
 
 
369 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.94 
 
 
346 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.59 
 
 
370 aa  278  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  48.79 
 
 
405 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.92 
 
 
426 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.95 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  48.99 
 
 
353 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.37 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  46.95 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  49.83 
 
 
350 aa  271  8.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  47.45 
 
 
373 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.36 
 
 
362 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  47.72 
 
 
365 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.28 
 
 
438 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.69 
 
 
435 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.69 
 
 
435 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.94 
 
 
347 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.72 
 
 
387 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  45 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.33 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  47.69 
 
 
354 aa  269  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  46.48 
 
 
337 aa  269  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.15 
 
 
361 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.04 
 
 
406 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  45.95 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.17 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 
425 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.02 
 
 
406 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.05 
 
 
357 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.4 
 
 
345 aa  266  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  45.05 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  49.09 
 
 
390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.22 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.04 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  46.48 
 
 
343 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  46.48 
 
 
408 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  43.38 
 
 
394 aa  265  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.48 
 
 
408 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.66 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.75 
 
 
426 aa  265  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  46.18 
 
 
332 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 
417 aa  265  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  46.48 
 
 
408 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.5 
 
 
353 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  45.97 
 
 
370 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.38 
 
 
343 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.97 
 
 
407 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  46.55 
 
 
364 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.31 
 
 
395 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.45 
 
 
379 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.83 
 
 
397 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  50.67 
 
 
362 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  48.78 
 
 
390 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  45.07 
 
 
358 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
396 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  46.79 
 
 
338 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  54.06 
 
 
423 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  46.67 
 
 
407 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.83 
 
 
338 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  44.88 
 
 
408 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  49.84 
 
 
363 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  47.15 
 
 
355 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  46.57 
 
 
357 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  47.92 
 
 
341 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.16 
 
 
419 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>