More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0220 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  100 
 
 
327 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  95.11 
 
 
327 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  94.5 
 
 
327 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  88.38 
 
 
327 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  64.51 
 
 
329 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  66.36 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  66.67 
 
 
329 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  64.22 
 
 
329 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  63 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  63.3 
 
 
329 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  61.77 
 
 
338 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  62.88 
 
 
342 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  58.46 
 
 
329 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  59.38 
 
 
343 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  58.46 
 
 
329 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.36 
 
 
350 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  58.9 
 
 
352 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  58.41 
 
 
359 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.71 
 
 
337 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  56.7 
 
 
346 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.62 
 
 
343 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.09 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.02 
 
 
397 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  46.34 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.45 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.93 
 
 
337 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.49 
 
 
370 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.17 
 
 
425 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  47.15 
 
 
353 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  48.94 
 
 
350 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  46.34 
 
 
327 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.94 
 
 
364 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  48.35 
 
 
373 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.33 
 
 
365 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  48.35 
 
 
373 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.55 
 
 
369 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  47.72 
 
 
346 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  48.63 
 
 
364 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.63 
 
 
365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.92 
 
 
426 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.94 
 
 
366 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.35 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  47.27 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  46.97 
 
 
372 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  46.73 
 
 
435 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.73 
 
 
435 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 
438 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 
426 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  47.11 
 
 
354 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  47.42 
 
 
372 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.58 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  47.87 
 
 
338 aa  269  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.03 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  45.78 
 
 
408 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  48.11 
 
 
405 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  48.05 
 
 
363 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.84 
 
 
417 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  47.71 
 
 
362 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  48.76 
 
 
428 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.43 
 
 
439 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.48 
 
 
406 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.36 
 
 
336 aa  267  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.42 
 
 
387 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.68 
 
 
397 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  47.69 
 
 
427 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.36 
 
 
362 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  52.8 
 
 
423 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.33 
 
 
327 aa  265  7e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  47.09 
 
 
332 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  47.69 
 
 
428 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  47.16 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.19 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  43.08 
 
 
394 aa  264  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  47.13 
 
 
345 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.01 
 
 
402 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  46.6 
 
 
349 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  48 
 
 
334 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.69 
 
 
406 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  47.69 
 
 
428 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  47.38 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.29 
 
 
407 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  47.27 
 
 
370 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  47.43 
 
 
390 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  50.93 
 
 
348 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  45.35 
 
 
408 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  47.13 
 
 
390 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  47.56 
 
 
424 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  45.35 
 
 
408 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  46.5 
 
 
430 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48 
 
 
428 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  46.87 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  47.45 
 
 
361 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  45.87 
 
 
343 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.9 
 
 
430 aa  262  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.1 
 
 
357 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>