More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3641 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  100 
 
 		 348 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  57.88 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.4 
 
 		 426 aa  352  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  56.36 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  56.67 
 
 		 338 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  58.48 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.74 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  53.1 
 
 		 427 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 440 aa  332  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  55.19 
 
 		 435 aa  328  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  55.39 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  54.07 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.13 
 
 		 387 aa  326  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  55.86 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.68 
 
 		 425 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  53.49 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.19 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  56.72 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.63 
 
 		 356 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  55.73 
 
 		 338 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.06 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  52.87 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.54 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  53.91 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  53.22 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  53.2 
 
 		 428 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  53.22 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  55.19 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  53.3 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  54.46 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.01 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.23 
 
 		 434 aa  314  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  57.31 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  54.91 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.9 
 
 		 345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  57.31 
 
 		 354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  57.31 
 
 		 354 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  55.06 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.22 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  52.42 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  52.17 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  52.82 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 407 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 407 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  52.54 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.79 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.59 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  52.01 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  52.01 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  52.19 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.15 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  52.2 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  52.06 
 
 		 363 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  56.69 
 
 		 423 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.54 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.66 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  54.19 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  53.61 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 389 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  53.54 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 365 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 343 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 372 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 372 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 428 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 428 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>