More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2382 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  100 
 
 		 428 aa  867    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  100 
 
 		 428 aa  867    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  56.64 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  56.51 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.58 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  54.33 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.89 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.05 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  52.18 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  49.2 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  51.26 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  49.2 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  50 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  50.69 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  50 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  50 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.36 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 437 aa  362  6e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.71 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  48.86 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.78 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.83 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.3 
 
 		 426 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.5 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.87 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.8 
 
 		 346 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.39 
 
 		 482 aa  338  9e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  44.19 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.49 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  49.42 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  46.3 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  48.72 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  49.3 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.9 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.6 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.67 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.12 
 
 		 338 aa  319  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  44.57 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 338 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.4 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.76 
 
 		 338 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.54 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  52.45 
 
 		 338 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.21 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.37 
 
 		 333 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.72 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.55 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.23 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.09 
 
 		 415 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.53 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40.05 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.77 
 
 		 373 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 353 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  50.29 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.24 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.65 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.2 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.8 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  49.72 
 
 		 355 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 370 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.39 
 
 		 350 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 365 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  41.18 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  46.81 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  43.48 
 
 		 424 aa  286  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  42.82 
 
 		 493 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  43.74 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.15 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  43.25 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.05 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>