More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0849 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  99.08 
 
 
435 aa  858    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  100 
 
 
435 aa  865    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  62.07 
 
 
434 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  55.43 
 
 
439 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  53.33 
 
 
440 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.21 
 
 
427 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.35 
 
 
423 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.38 
 
 
417 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  50.23 
 
 
422 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.05 
 
 
426 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.75 
 
 
482 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.45 
 
 
463 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.11 
 
 
464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  56.73 
 
 
346 aa  352  8e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.26 
 
 
425 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.88 
 
 
464 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  49.65 
 
 
439 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.55 
 
 
425 aa  349  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.73 
 
 
454 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.54 
 
 
437 aa  346  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.79 
 
 
434 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.02 
 
 
419 aa  343  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  47.8 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.84 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.13 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  47.9 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  47.48 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  47.48 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  47.1 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  47.22 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  46.87 
 
 
428 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  46.87 
 
 
428 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  46.87 
 
 
428 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.6 
 
 
438 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  46.64 
 
 
428 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  46.64 
 
 
428 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  47.1 
 
 
428 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.98 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.91 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  46.21 
 
 
428 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  55.83 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  47.66 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  45.73 
 
 
437 aa  326  5e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  55.96 
 
 
338 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  55.52 
 
 
338 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  56.92 
 
 
353 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  46.26 
 
 
430 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.1 
 
 
439 aa  323  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  46.26 
 
 
430 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.26 
 
 
429 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  45.85 
 
 
435 aa  320  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  55.79 
 
 
327 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  48.04 
 
 
423 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.39 
 
 
426 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.77 
 
 
415 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.96 
 
 
426 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50 
 
 
387 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  45.48 
 
 
430 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  49.65 
 
 
424 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.18 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  43.35 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.71 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  54.63 
 
 
337 aa  312  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  50.11 
 
 
425 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0505  GTPase ObgE  42.01 
 
 
435 aa  306  3e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  51.52 
 
 
337 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  53.52 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.58 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.38 
 
 
354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.38 
 
 
354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.37 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  53.82 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.46 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.08 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  51.98 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.38 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  49.7 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  45.88 
 
 
516 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  56.84 
 
 
343 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  54.27 
 
 
338 aa  301  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.31 
 
 
416 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  53.52 
 
 
365 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.52 
 
 
428 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  55.39 
 
 
348 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  44.83 
 
 
433 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.85 
 
 
397 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  42.49 
 
 
424 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  43.59 
 
 
450 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.33 
 
 
458 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  43.58 
 
 
519 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  45.07 
 
 
457 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  42.26 
 
 
424 aa  293  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.96 
 
 
453 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.29 
 
 
370 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.21 
 
 
365 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  50 
 
 
350 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.71 
 
 
356 aa  292  9e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.29 
 
 
379 aa  292  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.99 
 
 
427 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.96 
 
 
341 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>