More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0196 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  94.72 
 
 		 370 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  100 
 
 		 362 aa  738    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  81.38 
 
 		 370 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  78.01 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  79.53 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  78.61 
 
 		 365 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  79.23 
 
 		 364 aa  524  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  76.12 
 
 		 372 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  79.53 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  74.86 
 
 		 372 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  79.58 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  78.68 
 
 		 370 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  76.97 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  81.38 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  76.97 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  77.91 
 
 		 373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  81.08 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  81.08 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  80.48 
 
 		 369 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  67.85 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.47 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  67.9 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  65.91 
 
 		 361 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  67.33 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  67.23 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  65.91 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.92 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  66.01 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  64.17 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  69.12 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  64.93 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  69.45 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  66.08 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  62.67 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  59.78 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  59.78 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  59.5 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  59.76 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  58.82 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  58.31 
 
 		 358 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  59.17 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  55.34 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  59.5 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  57.26 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  58.1 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  59.03 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  58.72 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  58.38 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  59 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  59.78 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  58.55 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  60.27 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  59.23 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  60.27 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  57.89 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  57.74 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.75 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  56.71 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  58.7 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  58.41 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  56.21 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  57.1 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  59.82 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  58.33 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  60.12 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  58.21 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  58.21 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  58.21 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  58.69 
 
 		 350 aa  355  7.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  58.19 
 
 		 346 aa  352  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.74 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  57.74 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  55.87 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  57.36 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  54.74 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  56.21 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.64 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  56.8 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 357 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  57.1 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>