More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0185 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
417 aa  827    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  63.59 
 
 
423 aa  458  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.67 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  65.24 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  57.48 
 
 
422 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  54.35 
 
 
427 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.54 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.77 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  63.08 
 
 
346 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  53.29 
 
 
428 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  55.16 
 
 
428 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  57.68 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  54.07 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  55.63 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  53.76 
 
 
428 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  53.29 
 
 
428 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  53.38 
 
 
435 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  53.7 
 
 
435 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  52.82 
 
 
428 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.42 
 
 
424 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  52.11 
 
 
428 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  52.47 
 
 
427 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.65 
 
 
423 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.55 
 
 
464 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.45 
 
 
463 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
482 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.93 
 
 
434 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  59.38 
 
 
338 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  51.05 
 
 
430 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.45 
 
 
452 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.89 
 
 
426 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  50.35 
 
 
430 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  50.35 
 
 
430 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.94 
 
 
435 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.67 
 
 
464 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.77 
 
 
438 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  47.14 
 
 
439 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  51.84 
 
 
437 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  57.23 
 
 
338 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  59.08 
 
 
338 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  57.54 
 
 
338 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  51.73 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.46 
 
 
387 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  48.83 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  48.83 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  56.92 
 
 
338 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  56.62 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  52.1 
 
 
439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.88 
 
 
439 aa  349  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.63 
 
 
426 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  48.48 
 
 
428 aa  347  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  52 
 
 
454 aa  345  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  53.85 
 
 
338 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.19 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  57.44 
 
 
353 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.5 
 
 
458 aa  341  2e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  44.93 
 
 
436 aa  335  7.999999999999999e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.52 
 
 
429 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  47.11 
 
 
437 aa  331  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  46.33 
 
 
439 aa  330  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  56.18 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.54 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  56.18 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  56.18 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  52.1 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.07 
 
 
333 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.31 
 
 
427 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.49 
 
 
345 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  55.89 
 
 
356 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  52.1 
 
 
407 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  43.81 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  54.35 
 
 
356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  44.84 
 
 
424 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  53.07 
 
 
370 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  45.43 
 
 
424 aa  319  5e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.58 
 
 
408 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.58 
 
 
408 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  54.4 
 
 
327 aa  319  6e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  54.09 
 
 
337 aa  319  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  54.09 
 
 
337 aa  319  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  49.3 
 
 
408 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.95 
 
 
347 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  55.28 
 
 
350 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  53.75 
 
 
353 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  45.43 
 
 
424 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.03 
 
 
415 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  53.07 
 
 
334 aa  318  2e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.42 
 
 
336 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.02 
 
 
408 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  54.35 
 
 
349 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.85 
 
 
371 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.05 
 
 
340 aa  315  8e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.75 
 
 
326 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  54.05 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>