More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1072 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  100 
 
 
436 aa  887    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  60.36 
 
 
439 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  57.74 
 
 
428 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  57.44 
 
 
437 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.14 
 
 
438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  56.12 
 
 
432 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  56.39 
 
 
435 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  55.09 
 
 
430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  55.09 
 
 
430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  54.84 
 
 
430 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  54.71 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  54.94 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  55.17 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  54.71 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.17 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  55.96 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.48 
 
 
428 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  54.71 
 
 
428 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  54.71 
 
 
428 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.48 
 
 
428 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  54.48 
 
 
427 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  54.71 
 
 
428 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  50.92 
 
 
428 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.24 
 
 
427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.39 
 
 
422 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.7 
 
 
426 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.81 
 
 
425 aa  349  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.05 
 
 
426 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.7 
 
 
419 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.6 
 
 
425 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  44.93 
 
 
423 aa  335  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.93 
 
 
417 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  45.6 
 
 
424 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.08 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  46.9 
 
 
424 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.39 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  44.57 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  44.57 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.84 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  42.69 
 
 
434 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  44.27 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.94 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.99 
 
 
426 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.06 
 
 
439 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.74 
 
 
454 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.09 
 
 
435 aa  300  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.88 
 
 
346 aa  297  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.08 
 
 
338 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  47.99 
 
 
343 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.2 
 
 
458 aa  293  4e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.48 
 
 
370 aa  292  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  41.91 
 
 
435 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  41.91 
 
 
435 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.04 
 
 
482 aa  289  7e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  44.88 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  44.6 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  46.4 
 
 
338 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  47.8 
 
 
354 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  45.19 
 
 
357 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  44.47 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  47.2 
 
 
354 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  47.2 
 
 
354 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.45 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  44.2 
 
 
408 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.06 
 
 
329 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.06 
 
 
329 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.4 
 
 
369 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  48.16 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.04 
 
 
337 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  45.51 
 
 
365 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.71 
 
 
353 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  42.14 
 
 
433 aa  281  2e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  46.24 
 
 
406 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  37.75 
 
 
500 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.04 
 
 
338 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  45.96 
 
 
406 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.35 
 
 
362 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  46.61 
 
 
370 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  44.51 
 
 
345 aa  279  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  48.68 
 
 
350 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.88 
 
 
350 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  46.04 
 
 
408 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  45.4 
 
 
405 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.04 
 
 
408 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  43.05 
 
 
366 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  46.45 
 
 
347 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  46.99 
 
 
357 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  45.83 
 
 
370 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  45.37 
 
 
397 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  46.02 
 
 
372 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.29 
 
 
379 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  45.64 
 
 
407 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  40.84 
 
 
541 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  43.71 
 
 
338 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  46.02 
 
 
372 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  46.02 
 
 
372 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  45.43 
 
 
408 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  46.02 
 
 
372 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.29 
 
 
357 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>