More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1873 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  100 
 
 		 425 aa  839    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.24 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.38 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  62.53 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.67 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  59.44 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  59 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  54.67 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  52.94 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  53.27 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.75 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  59.72 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  53.04 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.29 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  53.61 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  51.61 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.61 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  51.61 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  51.75 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.55 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.22 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  50.93 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.11 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.22 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  49.89 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.89 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.23 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  50.34 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  54.21 
 
 		 439 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  59.63 
 
 		 346 aa  364  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.22 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.99 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  58.84 
 
 		 338 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.02 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.8 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  49.89 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.76 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  57.01 
 
 		 338 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.9 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  56.71 
 
 		 338 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.76 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.59 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.31 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  56.79 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  59.88 
 
 		 353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  60.54 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.35 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.4 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  55.14 
 
 		 338 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  52.22 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  54.55 
 
 		 338 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  44.77 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.73 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  58.61 
 
 		 354 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  58.61 
 
 		 354 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  52.22 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.95 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.07 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  58.31 
 
 		 354 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  54.79 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  55.8 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  44.47 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.61 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.62 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.54 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  47.27 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  42.99 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  48.07 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  56.11 
 
 		 327 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  50.23 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 379 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  51.96 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.72 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  53.71 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.55 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  44.14 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.36 
 
 		 505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  50 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>