More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4265 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 454 aa  902    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  92.01 
 
 		 439 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.09 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.15 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  53.15 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.82 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.47 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.24 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  52.64 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.88 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.53 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.41 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.22 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.81 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.87 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.8 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  49.77 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.12 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  46.88 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.62 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  53.99 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  46.88 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  46.88 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  47.09 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  50.82 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  52.47 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.63 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  46.47 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.11 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  43.64 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  46 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  44.8 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  47.22 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  46.12 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.99 
 
 		 426 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.39 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.95 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 353 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 354 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  43.74 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  43.74 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.8 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  46.49 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.52 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.81 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  41.27 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  46.7 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.87 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.22 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 493 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 346 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  54.04 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  53.27 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.75 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 392 aa  292  8e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.39 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.96 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.3 
 
 		 336 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.6 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.28 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  54.25 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.55 
 
 		 408 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.41 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.18 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.37 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.18 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.99 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.26 
 
 		 372 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.27 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>