More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1694 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  100 
 
 		 437 aa  878    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  73.46 
 
 		 437 aa  622  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  72.41 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  62.07 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  61.84 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.59 
 
 		 438 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  61.15 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  60.92 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  60.92 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  61.38 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  58.06 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  55.61 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  55.61 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  55.15 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  56.16 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  52.52 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.81 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  52.87 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.15 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.32 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.66 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.19 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.11 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.98 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.45 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.97 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  49.21 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.11 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.59 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.96 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  43.92 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.38 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  49.89 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.12 
 
 		 482 aa  319  6e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.36 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.35 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.17 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  42.79 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  56.14 
 
 		 346 aa  307  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.97 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.02 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.19 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.11 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  54.11 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.35 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.82 
 
 		 458 aa  299  8e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  42.47 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.33 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  41.65 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.42 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.79 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.28 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.94 
 
 		 415 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  54.95 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  51.93 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.88 
 
 		 338 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  53.06 
 
 		 338 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 343 aa  289  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.22 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.43 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  42.2 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  47.94 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.8 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 372 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.75 
 
 		 338 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.4 
 
 		 453 aa  285  9e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  47.94 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.72 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 402 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  48.78 
 
 		 373 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.62 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  47.76 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 350 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  41.84 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  46.47 
 
 		 350 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50 
 
 		 329 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>