More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1824 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  100 
 
 		 329 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  86.63 
 
 		 329 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  80.85 
 
 		 329 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  70.12 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  69.82 
 
 		 329 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  71.43 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  63.91 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  63.91 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  63.91 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  67.59 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  63.61 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  63.61 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  61.16 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  64.22 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.58 
 
 		 350 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  65.34 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  63.61 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  61.35 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  53.58 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  53.27 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 427 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.95 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  55.24 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  51.34 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  52.92 
 
 		 419 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.54 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.51 
 
 		 438 aa  279  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  51.08 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  54.11 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 354 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  47.27 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.16 
 
 		 482 aa  276  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.67 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  45.9 
 
 		 440 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.02 
 
 		 425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50.67 
 
 		 395 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.58 
 
 		 392 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  48.95 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  49.08 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.49 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 365 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.84 
 
 		 422 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 430 aa  271  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 430 aa  271  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.33 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.93 
 
 		 426 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  50.17 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  49.67 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.08 
 
 		 327 aa  270  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.62 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  48.2 
 
 		 373 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  47.87 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.78 
 
 		 406 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  48.05 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  52.43 
 
 		 406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.2 
 
 		 348 aa  265  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.81 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.83 
 
 		 429 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.8 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.8 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.38 
 
 		 423 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 430 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.9 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.69 
 
 		 434 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  51.94 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.09 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.84 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.84 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>