More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0442 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  100 
 
 		 358 aa  723    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  90.78 
 
 		 358 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  84.92 
 
 		 353 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  84.36 
 
 		 349 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  84.36 
 
 		 353 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  83.52 
 
 		 353 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  81.41 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.32 
 
 		 344 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.14 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.68 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.72 
 
 		 344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.29 
 
 		 342 aa  447  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.67 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.67 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.31 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.17 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.06 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  68.11 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  66.28 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  66.28 
 
 		 371 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  69.63 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  67.07 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.06 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  68.39 
 
 		 341 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  67.37 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  62.02 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  63.83 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  63.37 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.01 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  62.78 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  62.31 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  62.01 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  66.87 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  58.1 
 
 		 345 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  68.1 
 
 		 366 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.6 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  58.09 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.55 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.12 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.44 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.37 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  52.1 
 
 		 407 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.09 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 340 aa  305  9.000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.54 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.68 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.85 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.49 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  51.81 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.3 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.47 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 362 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  46.61 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.19 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  48.16 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.67 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.94 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.13 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.12 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  47.21 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.21 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  52.92 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.59 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.59 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.32 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>