More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1145 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  100 
 
 		 352 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  71.88 
 
 		 345 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  70.82 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  57.83 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  57.83 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  63.11 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  56.55 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  56.29 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  56.7 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  56.7 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.83 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  62.93 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.55 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  54.95 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  56.48 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  61.11 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.49 
 
 		 343 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.69 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.26 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.01 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.27 
 
 		 344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  56.36 
 
 		 339 aa  352  7e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.89 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.89 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  55.56 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  55.56 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  54.7 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  62.5 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.26 
 
 		 346 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  56.85 
 
 		 364 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  54.67 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  54.99 
 
 		 348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  56.89 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.83 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  54.55 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  59.72 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.17 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.23 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  47.58 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.15 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.43 
 
 		 392 aa  296  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.6 
 
 		 458 aa  295  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.05 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.28 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.28 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.8 
 
 		 426 aa  291  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 357 aa  288  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.78 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.88 
 
 		 370 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.16 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 362 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  47.02 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.01 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.13 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  46.7 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  47.79 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  44.85 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  48.87 
 
 		 391 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.04 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.36 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>