More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2056 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  100 
 
 		 366 aa  737    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  76.15 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  72.4 
 
 		 366 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  74.64 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  60.36 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  59.89 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.67 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.6 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.14 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  54.33 
 
 		 397 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.18 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.18 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.9 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.95 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.9 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.94 
 
 		 353 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 346 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.54 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.41 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.76 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 406 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.76 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.65 
 
 		 338 aa  292  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.45 
 
 		 406 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.64 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.78 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.76 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.09 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.85 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 338 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.51 
 
 		 370 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  51.12 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.21 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.58 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.7 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  48.64 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.21 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.62 
 
 		 369 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.13 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.49 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 405 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 370 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.67 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  48.36 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.74 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.09 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.94 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.21 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  46.33 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.05 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.24 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.87 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 338 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  47.27 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  46.13 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.37 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  48 
 
 		 424 aa  275  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  50.59 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  48 
 
 		 424 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  52.21 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.38 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  47.13 
 
 		 424 aa  272  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  47.37 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>