More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3419 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  100 
 
 		 345 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  62.16 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  60.29 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  61.86 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  57.77 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  60.6 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.81 
 
 		 333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.23 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  54.6 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.43 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.92 
 
 		 338 aa  298  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.61 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.25 
 
 		 417 aa  288  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  53.14 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  53.23 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.23 
 
 		 434 aa  285  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  48.47 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  53.17 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 405 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.41 
 
 		 424 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.32 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.64 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.64 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.35 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.66 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.98 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.41 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 406 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  51.32 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.64 
 
 		 350 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.72 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 435 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.23 
 
 		 423 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.07 
 
 		 407 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  48.08 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.25 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 370 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.11 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.93 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  49.85 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.98 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.36 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.15 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.05 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 370 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  49.23 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  50 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  50.29 
 
 		 419 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  47.01 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.67 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  48.31 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.17 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>