More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0069 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  100 
 
 		 337 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.43 
 
 		 334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  69.49 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.35 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  64.13 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  67.58 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  65.66 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  62.05 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  64.56 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  58.48 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.24 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  54.77 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  56.04 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  52 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.39 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 343 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  55.59 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.99 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.15 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.07 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.69 
 
 		 417 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.59 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.22 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.48 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  46.41 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.45 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  44.58 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.43 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.86 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.39 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  46.97 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.9 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.32 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.75 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  49.16 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.47 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.47 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.17 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.32 
 
 		 405 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  48.85 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  46.64 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  45.21 
 
 		 354 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  50 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 439 aa  255  9e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  46.44 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  44.91 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  45.62 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 428 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  48 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  45.51 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.63 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.88 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  45.64 
 
 		 408 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.79 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.37 
 
 		 438 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.28 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  45.3 
 
 		 408 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  45.3 
 
 		 408 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  49.66 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 428 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.9 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.15 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.74 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.9 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  47.01 
 
 		 432 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.46 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.66 
 
 		 680 aa  249  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  45.32 
 
 		 348 aa  249  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 371 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.74 
 
 		 463 aa  248  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.76 
 
 		 350 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.42 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.17 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  46.32 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.79 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  48.35 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.64 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  42.94 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  47.78 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  46.25 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  49.32 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.43 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  50.52 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  49.83 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  44.24 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>