More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4091 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  100 
 
 		 335 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.95 
 
 		 334 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  69.49 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  67.27 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  63.08 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  65.96 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  60.36 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  65.57 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.21 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  62.12 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  57.06 
 
 		 337 aa  349  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  56 
 
 		 340 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  54.88 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.6 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  55.08 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  56.17 
 
 		 338 aa  322  4e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  54.46 
 
 		 343 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  54.27 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.91 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.68 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.16 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.67 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  50 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.51 
 
 		 417 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  50.63 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.12 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  50.91 
 
 		 419 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 343 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.09 
 
 		 350 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.88 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.4 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.62 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.25 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.09 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  45.4 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  47.75 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.84 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.11 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.27 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  47.45 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  50.63 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  48.32 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.24 
 
 		 407 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  47.89 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.95 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  46.97 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.88 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.35 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.76 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  50.32 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.65 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  46.08 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  47.29 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  46.08 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  51.4 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.65 
 
 		 435 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 408 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  48.47 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  47 
 
 		 391 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.36 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.06 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.96 
 
 		 464 aa  262  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 		 482 aa  262  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  45.09 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  48.36 
 
 		 432 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  47.87 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  47.01 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.92 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.87 
 
 		 422 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.37 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.61 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  46.08 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  46.71 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 		 396 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>